Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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