Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC0.38□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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RTL8BQ17RB0 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
RTL8BQ17RB0 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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