Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SNAPC1Q16533 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SNAPC1Q16533 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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