Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GABRA6Q16445 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms