Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
USF2Q15853 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
USF2Q15853 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
USF2Q15853 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
USF2Q15853 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
USF2Q15853 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
USF2Q15853 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
USF2Q15853 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
USF2Q15853 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
USF2Q15853 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
USF2Q15853 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
USF2Q15853 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
USF2Q15853 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
USF2Q15853 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
USF2Q15853 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
USF2Q15853 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
USF2Q15853 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
USF2Q15853 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
USF2Q15853 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
USF2Q15853 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
USF2Q15853 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.26
USF2Q15853 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USF2Q15853 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USF2Q15853 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USF2Q15853 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USF2Q15853 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USF2Q15853 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USF2Q15853 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USF2Q15853 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USF2Q15853 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USF2Q15853 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
USF2Q15853 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
USF2Q15853 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USF2Q15853 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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