Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CCDC85BQ15834 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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