Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NPTX1Q15818 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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