Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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ALX1Q15699 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ALX1Q15699 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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ALX1Q15699 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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ALX1Q15699 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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ALX1Q15699 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ALX1Q15699 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC0.07□□□□□ -2.4
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