Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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SEC23BQ15437 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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SEC23BQ15437 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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SEC23BQ15437 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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SEC23BQ15437 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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SEC23BQ15437 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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SEC23BQ15437 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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SEC23BQ15437 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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SEC23BQ15437 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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SEC23BQ15437 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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SEC23BQ15437 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEC23BQ15437 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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