Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
BRD3Q15059 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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BRD3Q15059 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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BRD3Q15059 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
BRD3Q15059 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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