Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HERPUD1Q15011 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HERPUD1Q15011 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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