Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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NR1I3Q14994 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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NR1I3Q14994 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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NR1I3Q14994 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NR1I3Q14994 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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