Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
SCN5AQ14524 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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