Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SPIDRQ14159 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.4 ms