Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CNGB1Q14028 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CNGB1Q14028 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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