Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.71□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
PKP1Q13835 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PKP1Q13835 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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