Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
APOFQ13790 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
APOFQ13790 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
APOFQ13790 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
APOFQ13790 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
APOFQ13790 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
APOFQ13790 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
APOFQ13790 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 459.4 ms