Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CACNA1SQ13698 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms