Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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PTCH1Q13635 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTCH1Q13635 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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PTCH1Q13635 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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PTCH1Q13635 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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PTCH1Q13635 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTCH1Q13635 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTCH1Q13635 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTCH1Q13635 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTCH1Q13635 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTCH1Q13635 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTCH1Q13635 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTCH1Q13635 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTCH1Q13635 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTCH1Q13635 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTCH1Q13635 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTCH1Q13635 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTCH1Q13635 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTCH1Q13635 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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