Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBB3Q13509 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBB3Q13509 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBB3Q13509 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBB3Q13509 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBB3Q13509 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBB3Q13509 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBB3Q13509 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBB3Q13509 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBB3Q13509 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBB3Q13509 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBB3Q13509 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBB3Q13509 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBB3Q13509 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBB3Q13509 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBB3Q13509 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBB3Q13509 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBB3Q13509 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBB3Q13509 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBB3Q13509 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBB3Q13509 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBB3Q13509 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TUBB3Q13509 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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TUBB3Q13509 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
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TUBB3Q13509 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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TUBB3Q13509 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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TUBB3Q13509 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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TUBB3Q13509 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
TUBB3Q13509 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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