Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SMAD4Q13485 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SMAD4Q13485 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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