| MPP3 | Q13368 | TRDN-201 | ENST00000334268 | 4770 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| MPP3 | Q13368 | CCDC82-201 | ENST00000278520 | 2941 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| MPP3 | Q13368 | DNAH12-208 | ENST00000495027 | 12146 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.89 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNA5SP72-201 | ENST00000364442 | 117 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU1-73P-201 | ENST00000383971 | 164 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-72P-201 | ENST00000384285 | 79 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR670-201 | ENST00000390142 | 98 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | U3.19-201 | ENST00000390893 | 196 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | SNORA48.7-201 | ENST00000391302 | 135 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR190B-201 | ENST00000401119 | 79 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | RPS29P13-201 | ENST00000402041 | 169 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL603908.1-201 | ENST00000406098 | 201 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | RN7SKP27-201 | ENST00000410684 | 333 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | NDUFS5P4-201 | ENST00000412983 | 318 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC139712.2-201 | ENST00000424302 | 339 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC005300.1-201 | ENST00000428401 | 373 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | Z82188.1-201 | ENST00000436709 | 154 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC109925.1-201 | ENST00000478069 | 331 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC008948.1-201 | ENST00000506058 | 325 nt | TSL 2 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU1-103P-201 | ENST00000516502 | 125 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
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| MPP3 | Q13368 | AP002992.1-202 | ENST00000530842 | 551 nt | TSL 2 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
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| MPP3 | Q13368 | AC093831.2-201 | ENST00000624393 | 3427 nt | BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | ZNF479-202 | ENST00000331162 | 2072 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | MLF1-203 | ENST00000392822 | 2157 nt | TSL 5 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | CASP1-201 | ENST00000353247 | 423 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.27-201 | ENST00000362540 | 103 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-212P-201 | ENST00000362642 | 104 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.84-201 | ENST00000363011 | 104 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNA5SP267-201 | ENST00000364893 | 126 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | Z98749.2-208 | ENST00000381646 | 500 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-209P-201 | ENST00000384118 | 107 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | RPL21P75-201 | ENST00000396599 | 483 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | AP003170.3-201 | ENST00000399123 | 158 nt | TSL 5 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | RPL21P28-201 | ENST00000401418 | 483 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-1203P-201 | ENST00000410703 | 110 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
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| MPP3 | Q13368 | RNU2-25P-201 | ENST00000411041 | 191 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
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| MPP3 | Q13368 | AC069079.1-201 | ENST00000419889 | 400 nt | TSL 3 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL590556.1-201 | ENST00000423231 | 483 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
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| MPP3 | Q13368 | INTS6-AS1-201 | ENST00000434512 | 466 nt | TSL 3 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC007179.2-207 | ENST00000435557 | 556 nt | TSL 4 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | MTND2P29-201 | ENST00000438595 | 412 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | Z75741.1-201 | ENST00000446793 | 314 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC114501.3-201 | ENST00000453648 | 164 nt | TSL 5 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL354824.2-201 | ENST00000458004 | 446 nt | TSL 3 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU7-87P-201 | ENST00000459343 | 62 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | RPL21P39-201 | ENST00000463605 | 483 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | RN7SL601P-201 | ENST00000471221 | 293 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC087190.1-201 | ENST00000484462 | 480 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
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| MPP3 | Q13368 | AC097372.5-201 | ENST00000623665 | 376 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC110079.1-202 | ENST00000635213 | 138 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | U6.99-201 | ENST00000637524 | 83 nt | BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | BCLAF1-205 | ENST00000527536 | 5371 nt | TSL 5 BASIC | 3.2 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | PPIP5K2-203 | ENST00000414217 | 5842 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | CHD9-203 | ENST00000447540 | 11509 nt | TSL 5 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | PRKG2-206 | ENST00000545647 | 3852 nt | TSL 5 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | snoU2_19.2-201 | ENST00000363024 | 80 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNA5SP139-201 | ENST00000364340 | 117 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | BPY2DP-201 | ENST00000422208 | 265 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC006028.1-201 | ENST00000438379 | 402 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | RPL37P4-201 | ENST00000448908 | 268 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | PRSS3P4-201 | ENST00000453323 | 162 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | RN7SKP210-201 | ENST00000459176 | 261 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | TOMM22P6-201 | ENST00000465035 | 409 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | RAC1P5-201 | ENST00000512182 | 576 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-56P-201 | ENST00000516986 | 93 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | SNORA31.18-201 | ENST00000517043 | 134 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC084816.1-207 | ENST00000538317 | 584 nt | TSL 4 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL442163.3-201 | ENST00000554110 | 156 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC026462.2-201 | ENST00000565771 | 286 nt | TSL 2 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC104581.2-201 | ENST00000572227 | 430 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC136932.1-201 | ENST00000574771 | 208 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL355877.2-201 | ENST00000603670 | 358 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC084757.4-201 | ENST00000616350 | 526 nt | BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | OR4C16-201 | ENST00000623907 | 933 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | PRKACB-217 | ENST00000610457 | 4206 nt | TSL 2 BASIC | 3.19 | □□□□□ -1.9 | | |
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| MPP3 | Q13368 | RNU6-105P-201 | ENST00000363909 | 104 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |
| MPP3 | Q13368 | SNORD27-201 | ENST00000363981 | 72 nt | BASIC | 3.18 | □□□□□ -1.9 | | |