Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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SKP2Q13309 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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SKP2Q13309 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
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SKP2Q13309 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
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SKP2Q13309 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
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SKP2Q13309 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
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SKP2Q13309 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SKP2Q13309 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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