Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
TRIM28Q13263 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms