Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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