Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RESTQ13127 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RESTQ13127 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RESTQ13127 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RESTQ13127 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms