Protein–RNA interactions for Protein: Q10472

GALNT1, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT1Q10472 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GALNT1Q10472 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.5 ms