Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.75□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CENPEQ02224 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC-0.8□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CENPEQ02224 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms