Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPFP49454 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC-1.02□□□□□ -2.57
CENPFP49454 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPFP49454 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPFP49454 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPFP49454 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPFP49454 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPFP49454 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
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CENPFP49454 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPFP49454 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
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CENPFP49454 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPFP49454 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPFP49454 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPFP49454 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
CENPFP49454 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
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CENPFP49454 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPFP49454 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPFP49454 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPFP49454 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPFP49454 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPFP49454 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPFP49454 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPFP49454 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPFP49454 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPFP49454 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPFP49454 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPFP49454 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPFP49454 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPFP49454 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPFP49454 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPFP49454 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPFP49454 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
CENPFP49454 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
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CENPFP49454 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
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CENPFP49454 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
CENPFP49454 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
CENPFP49454 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPFP49454 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPFP49454 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPFP49454 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPFP49454 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPFP49454 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPFP49454 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPFP49454 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC-1.08□□□□□ -2.58
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CENPFP49454 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPFP49454 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPFP49454 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPFP49454 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPFP49454 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
CENPFP49454 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
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