Protein–RNA interactions for Protein: P28356

HOXD9, Homeobox protein Hox-D9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9P28356 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HOXD9P28356 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HOXD9P28356 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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