Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.35
PTPRGP23470 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRGP23470 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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