Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
PTPRBP23467 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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PTPRBP23467 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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