Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CTIFO43310 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CTIFO43310 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
CTIFO43310 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CTIFO43310 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CTIFO43310 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CTIFO43310 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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