Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
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