Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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SH3BP1Q9Y3L3 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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SH3BP1Q9Y3L3 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SH3BP1Q9Y3L3 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
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SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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