Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
EHD3Q9NZN3 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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