Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
CIPCQ9C0C6 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CIPCQ9C0C6 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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