Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PHF12Q96QT6 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms