Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
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ZBED3Q96IU2 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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ZBED3Q96IU2 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
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ZBED3Q96IU2 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
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ZBED3Q96IU2 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
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ZBED3Q96IU2 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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ZBED3Q96IU2 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
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ZBED3Q96IU2 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
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ZBED3Q96IU2 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
ZBED3Q96IU2 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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