Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZNF548Q8NEK5 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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