Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
OTOP3Q7RTS5 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
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