Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
C1orf140Q5VVS0 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms