Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTXN3Q4LDR2 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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