Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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PTPROQ16827 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
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PTPROQ16827 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
PTPROQ16827 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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PTPROQ16827 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
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PTPROQ16827 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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PTPROQ16827 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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PTPROQ16827 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
PTPROQ16827 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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