Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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RTN1Q16799 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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RTN1Q16799 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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RTN1Q16799 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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RTN1Q16799 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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RTN1Q16799 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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RTN1Q16799 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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RTN1Q16799 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
RTN1Q16799 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
RTN1Q16799 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
RTN1Q16799 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTN1Q16799 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTN1Q16799 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTN1Q16799 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
RTN1Q16799 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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