Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
HIF1AQ16665 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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