Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDB1Q16531 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
DDB1Q16531 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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