Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
GRIK4Q16099 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GRIK4Q16099 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms