Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SMAD1Q15797 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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