Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.29□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HMGN3Q15651 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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